安装R包常见的方法
首先尝试从 CRAN 安装:
直接安装
install.packages("test")
带参数的(加上lib参数可以指定自定义库路径)
install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Matrix/Matrix_1.6-1.1.tar.gz", repos = NULL)
如果从 CRAN 安装失败,尝试从 Bioconductor 安装:
BiocManager::install("test")
如果以上两种方法都不行,尝试从 GitHub 安装:
devtools::install_github("example/test")
在 Ubuntu 环境下从 GitHub 克隆并安装 R 包:
从 GitHub 克隆代码:
git clone https://github.com/example/test.git
克隆目录为 /root/packages。
进入克隆的目录:
cd /root/packages/test
创建 .tar.gz 文件:
R CMD build .
这将生成一个 .tar.gz 文件,比如 test_1.0.tar.gz。
安装压缩包的 R 包:
install.packages("/root/packages/test/test_1.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
注意:"example/test" 是具体的 GitHub 路径,请确保这是正确的路径。
在 4. 中可以 直接切换到目录后进入 R 进行安装
install.packages(".", repos = NULL, type = "source")